Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RPA4Q13156 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RPA4Q13156 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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