Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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TRAF2Q12933 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17■□□□□ 0.31
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TRAF2Q12933 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TRAF2Q12933 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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