Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PTPN13Q12923 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
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