Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
BPTFQ12830 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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BPTFQ12830 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
BPTFQ12830 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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