Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NUP160Q12769 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NUP160Q12769 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
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