Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CGNL1Q0VF96 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms