Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NIPAL4Q0D2K0 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms