Protein–RNA interactions for Protein: Q08116

RGS1, Regulator of G-protein signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS1Q08116 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RGS1Q08116 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGS1Q08116 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGS1Q08116 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGS1Q08116 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGS1Q08116 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RGS1Q08116 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RGS1Q08116 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RGS1Q08116 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms