Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RUNX1T1Q06455 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RUNX1T1Q06455 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms