Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EXOSC9Q06265 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EXOSC9Q06265 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms