Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CENPCQ03188 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CENPCQ03188 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms