Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDR2Q01850 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms