Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MDM2Q00987 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
MDM2Q00987 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms