Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
FAM3AP98173 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms