Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
HBBP68871 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
HBBP68871 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
HBBP68871 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
HBBP68871 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms