Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERVK_113P63132 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P63132 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms