Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ETV1P50549 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ETV1P50549 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ETV1P50549 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ETV1P50549 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ETV1P50549 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms