Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
PIP4K2AP48426 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PIP4K2AP48426 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms