Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCR1P46094 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCR1P46094 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCR1P46094 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCR1P46094 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
XCR1P46094 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCR1P46094 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
XCR1P46094 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
XCR1P46094 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
XCR1P46094 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XCR1P46094 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCR1P46094 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCR1P46094 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCR1P46094 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCR1P46094 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCR1P46094 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCR1P46094 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XCR1P46094 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms