Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ETV4P43268 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ETV4P43268 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ETV4P43268 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ETV4P43268 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms