Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMPOP42166 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMPOP42166 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMPOP42166 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMPOP42166 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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