Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FDFT1P37268 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms