Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
GJA4P35212 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GJA4P35212 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GJA4P35212 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms