Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTX2P32243 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTX2P32243 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTX2P32243 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTX2P32243 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTX2P32243 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTX2P32243 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
OTX2P32243 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms