Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HTR1EP28566 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HTR1EP28566 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms