Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNMT1P26358 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNMT1P26358 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms