Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5F1P24539 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms