Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRGP23470 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms