Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TNNI3P19429 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TNNI3P19429 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms