Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB6P18564 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB6P18564 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB6P18564 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB6P18564 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB6P18564 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB6P18564 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB6P18564 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB6P18564 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ITGB6P18564 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGB6P18564 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms