Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NSD2O96028 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NSD2O96028 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NSD2O96028 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NSD2O96028 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms