Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRATO95237 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRATO95237 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRATO95237 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRATO95237 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LRATO95237 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LRATO95237 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms