Protein–RNA interactions for Protein: O75346

ZNF253, Zinc finger protein 253, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF253O75346 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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ZNF253O75346 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ZNF253O75346 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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