Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
UBDO15205 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
UBDO15205 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
UBDO15205 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
UBDO15205 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
UBDO15205 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms