Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CTDSP2O14595 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms