Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
C9orf92A6NGG3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms