Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SSPOA2VEC9 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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