Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNX8Q9Y5X2 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms