Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GINS2Q9Y248 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms