Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SORCS3Q9UPU3 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms