Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RIMS3Q9UJD0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms