Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SFMBT1Q9UHJ3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SFMBT1Q9UHJ3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms