Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC6

CNTNAP2, Contactin-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP2Q9UHC6 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTNAP2Q9UHC6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CNTNAP2Q9UHC6 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms