Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ABCF2Q9UG63 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ABCF2Q9UG63 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms