Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFT172Q9UG01 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms