Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NKX1-2Q9UD57 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NKX1-2Q9UD57 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms