Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LHX3Q9UBR4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX3Q9UBR4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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