Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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HOXC10Q9NYD6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HOXC10Q9NYD6 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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