Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VNN3Q9NY84 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
VNN3Q9NY84 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms