Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KRT82Q9NSB4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KRT82Q9NSB4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms